Colecciones nucleares de peral y manzano

Las colecciones nucleares de peral y manzano han sido identificadas a partir de la caracterización molecular realizada por el Grupo de Fruticultura y Viticultura Avanzadas del Departamento de Agronomía, Biotecnología y Alimentación de la Universidad Pública de Navarra. El trabajo ha sido realizado por C. Miranda, investigador del citado Grupo.

Para cada especie se dan dos listas. Una denominada colección mínima de accesiones y otra denominada colección total.

La colección mínima se ha determinado usando el programa de optimización CoreHunter, con repetición de 100 veces el proceso de selección de accesiones, usando como criterios:

  1. Minimizar la distancia entre cada accesión del banco y cada entrada en la colección nuclear (así se garantiza que las elegidas sean lo más representativas posible del banco). Este criterio tuvo un peso del 50% en la elección.
  2. Maximizar la distancia de Shannon-Weaver, con un peso del 25%, para garantizar que fuesen además accesiones lo más diferentes entre sí.
  3. Tratar de recuperar cuantos más alelos fuera posible, con un peso del 25%.

Las accesiones que eran elegidas con más frecuencia usando estos criterios en las 100 repeticiones del proceso eran las que terminaban integrando la lista mínima.

La colección total incluye, además de las accesiones de la lista mínima, las accesiones que habría que añadir para garantizar que la colección nuclear recupere el 100% de los alelos identificados.

En el manzano la colección mínima tiene 34 accesiones, lo que supone un 30% del Banco, y recupera un 94% de los alelos, lo que supone una buena representación. Para recuperar el 100% de alelos habría que tener 47 accesiones en la colección nuclear.

En el peral la colección mínima tiene 38 accesiones, lo que supone un 22% del Banco, y recupera el 95% de los alelos, lo que supone una buena representación. Para recuperar el 100% de alelos habría que tener 50 accesiones en la colección nuclear.


Colección nuclear de peral
Colección nuclear de manzano